A transferência de locais de algumas seções eleitorais causaram confusão ao longo do dia em Santa Cruz. Na Universidade de Santa Cruz do Sul, maior colégio eleitoral do município, a troca de seções do bloco 1 para o bloco 53 motivou críticas de eleitores. Também em função da troca, eleitores reclamaram na EMEI Paraíso Infantil, no Bairro Bom Jesus. No local ao menos cinco seções foram alteradas.
Já na Escolas Goiás, de acordo com a Justiça Eleitoral, agumas seções foram equalizadas. A situação também ocorreu em alguns colégios eleitorais de Vera Cruz.